2025年是农历庚寅年，庚属金，寅属木。而阴历五月初三这一日，按照天干地支纪年法，还需结合具体时辰来具体分析五行属性。这里我们不依赖具体的时辰，仅就日期的天干地支进行初步解析。
在这一天出生的宝宝，日干的天支可能对应的是土或者水（具体需根据出生时辰进一步推算）。根据五行相生相克的原理，我们进行如下分析：
1. 金行：在庚寅年，金元素已得到一定体现。金代表锐利、果断、智慧等特质。宝宝是否缺金，需根据命局综合判断。
2. 木行：寅属木，木元素在年份中已经较为旺盛。木代表生长、活力、创造力等特质。如宝宝命局中木已足够，则不需额外补充。
3. 水行：水行代表智慧、流通、变化等。在具体时辰中，如果水行不足，则可能表现在孩子性格上较为急躁或缺乏变通能力。
4. 火行：火行代表热情、活力、光明等。如孩子命局中缺乏火行，可能会在性格上表现出冷静过度或缺乏激情的一面。
5. 土行：土行代表稳重、承载、务实等特质。若宝宝命局中土行过重，可能表现为过于稳重或缺乏灵活性；若土行不足，则可能在成长过程中需要更多踏实稳定的能量。
要确定您儿子具体缺哪种五行，还需结合具体的出生时辰进行详细推算。但通过初步的解析，可以得出初步的结论：金和木在年份中已经有所体现，而水、火、土的属性则需要根据具体时辰进一步分析。